MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 101506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000962	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
2	NC_000962	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607143
3	NC_000962	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
4	NC_000962	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
5	NC_000962	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607143
6	NC_000962	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
7	NC_000962	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
8	NC_000962	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
9	NC_000962	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	15607143
10	NC_000962	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
11	NC_000962	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
12	NC_000962	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
13	NC_000962	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607143
14	NC_000962	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	15607143
15	NC_000962	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
16	NC_000962	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	15607143
17	NC_000962	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	15607143
18	NC_000962	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	15607143
19	NC_000962	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607143
20	NC_000962	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
21	NC_000962	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607143
22	NC_000962	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607143
23	NC_000962	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	15607143
24	NC_000962	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	15607143
25	NC_000962	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
26	NC_000962	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
27	NC_000962	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
28	NC_000962	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
29	NC_000962	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	15607143
30	NC_000962	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607143
31	NC_000962	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
32	NC_000962	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	15607143
33	NC_000962	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
34	NC_000962	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	15607144
35	NC_000962	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	15607144
36	NC_000962	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	15607144
37	NC_000962	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	15607144
38	NC_000962	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
39	NC_000962	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
40	NC_000962	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
41	NC_000962	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
42	NC_000962	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
43	NC_000962	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15607144
44	NC_000962	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	15607144
45	NC_000962	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
46	NC_000962	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
47	NC_000962	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607144
48	NC_000962	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607144
49	NC_000962	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
50	NC_000962	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607144
51	NC_000962	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	15607144
52	NC_000962	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
53	NC_000962	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607144
54	NC_000962	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	15607144
55	NC_000962	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607144
56	NC_000962	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	15607144
57	NC_000962	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607144
58	NC_000962	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
59	NC_000962	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	15607144
60	NC_000962	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	15607144
61	NC_000962	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607144
62	NC_000962	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	15607144
63	NC_000962	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	15607145
64	NC_000962	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
65	NC_000962	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
66	NC_000962	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	15607145
67	NC_000962	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
68	NC_000962	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
69	NC_000962	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607145
70	NC_000962	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607145
71	NC_000962	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
72	NC_000962	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	15607145
73	NC_000962	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
74	NC_000962	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607145
75	NC_000962	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	15607145
76	NC_000962	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
77	NC_000962	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	15607145
78	NC_000962	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607145
79	NC_000962	ATCG	2	8	4012	4019	25 %	25 %	25 %	25 %	15607145
80	NC_000962	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
81	NC_000962	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
82	NC_000962	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
83	NC_000962	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
84	NC_000962	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
85	NC_000962	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
86	NC_000962	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
87	NC_000962	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
88	NC_000962	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
89	NC_000962	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607145
90	NC_000962	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607145
91	NC_000962	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
92	NC_000962	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607146
93	NC_000962	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	15607146
94	NC_000962	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	15607146
95	NC_000962	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607146
96	NC_000962	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607146
97	NC_000962	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607146
98	NC_000962	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607146
99	NC_000962	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607146
100	NC_000962	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607146
101	NC_000962	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	15607146
102	NC_000962	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
103	NC_000962	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
104	NC_000962	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
105	NC_000962	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
106	NC_000962	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
107	NC_000962	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	448824735
108	NC_000962	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	448824735
109	NC_000962	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
110	NC_000962	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
111	NC_000962	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
112	NC_000962	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	448824735
113	NC_000962	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
114	NC_000962	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	448824735
115	NC_000962	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
116	NC_000962	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	448824735
117	NC_000962	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448824735
118	NC_000962	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
119	NC_000962	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
120	NC_000962	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
121	NC_000962	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
122	NC_000962	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
123	NC_000962	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	448824735
124	NC_000962	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
125	NC_000962	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	448824735
126	NC_000962	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	448824735
127	NC_000962	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
128	NC_000962	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	448824735
129	NC_000962	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448824735
130	NC_000962	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	448824735
131	NC_000962	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448824735
132	NC_000962	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
133	NC_000962	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
134	NC_000962	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
135	NC_000962	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448824735
136	NC_000962	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
137	NC_000962	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
138	NC_000962	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448824735
139	NC_000962	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448824735
140	NC_000962	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	448824735
141	NC_000962	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
142	NC_000962	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448824735
143	NC_000962	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
144	NC_000962	CG	3	6	7210	7215	0 %	0 %	50 %	50 %	448824735
145	NC_000962	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	15607148
146	NC_000962	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
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150	NC_000962	CG	3	6	7416	7421	0 %	0 %	50 %	50 %	15607148
151	NC_000962	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	15607148
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161	NC_000962	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
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168	NC_000962	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
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173	NC_000962	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
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245	NC_000962	GAG	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15607150
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247	NC_000962	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607151
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249	NC_000962	CGA	2	6	12761	12766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607151
250	NC_000962	TCA	2	6	12850	12855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607151
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252	NC_000962	CAG	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607152
253	NC_000962	C	6	6	13229	13234	0 %	0 %	0 %	100 %	15607152
254	NC_000962	GGC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607152
255	NC_000962	TCG	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607152
256	NC_000962	GAT	2	6	13298	13303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607152
257	NC_000962	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	15607152
258	NC_000962	GC	3	6	13389	13394	0 %	0 %	50 %	50 %	15607152
259	NC_000962	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	15607152
260	NC_000962	TGC	2	6	13551	13556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607152
261	NC_000962	CAA	2	6	13735	13740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607153
262	NC_000962	AAC	2	6	13886	13891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607153
263	NC_000962	ACCTTC	2	12	13919	13930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15607153
264	NC_000962	TTC	2	6	13967	13972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607153
265	NC_000962	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	15607154
266	NC_000962	GA	3	6	14126	14131	50 %	0 %	50 %	0 %	15607154
267	NC_000962	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	15607154
268	NC_000962	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	15607154
269	NC_000962	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	15607154
270	NC_000962	GCT	3	9	14196	14204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607154
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272	NC_000962	GGC	2	6	14227	14232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607154
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284	NC_000962	CGC	2	6	14685	14690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607154
285	NC_000962	CGC	3	9	14700	14708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607154
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395	NC_000962	CCG	2	6	19840	19845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607158
396	NC_000962	GAA	2	6	19863	19868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607158
397	NC_000962	CGG	2	6	19879	19884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607158
398	NC_000962	CGG	2	6	19894	19899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607158
399	NC_000962	CAG	2	6	20049	20054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607158
400	NC_000962	CCA	2	6	20059	20064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607158
401	NC_000962	TCG	2	6	20095	20100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607158
402	NC_000962	CGG	2	6	20141	20146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607158
403	NC_000962	AG	3	6	20221	20226	50 %	0 %	50 %	0 %	15607158
404	NC_000962	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	15607159
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454	NC_000962	GTA	2	6	22198	22203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607160
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462	NC_000962	GTC	3	9	22405	22413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607160
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474	NC_000962	CAG	2	6	22972	22977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607160
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480	NC_000962	CG	3	6	23172	23177	0 %	0 %	50 %	50 %	15607160
481	NC_000962	GTC	2	6	23337	23342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607161
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491	NC_000962	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	15607162
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493	NC_000962	TGG	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607162
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498	NC_000962	GCC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607162
499	NC_000962	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	15607162
500	NC_000962	CGTAGT	2	12	24229	24240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15607162

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